サンフランシスコ市の中央北部にある軍事基地プレシディオ。ある晩、基地内をパトロールしていた女性憲兵隊員が将校クラブに侵入した正体不明の2人組に射殺され、彼らを追ったパトカーも炎上するという事件が起こった。捜査を担当したのは市警察のジェイ・オースティン警部(マーク・ハーモン)。現場で彼を持ち受けていたのは憲兵隊長のアラン・コールドウェル中佐(ショーン・コネリー)。かつてオースティンは彼の部下の憲兵隊員であったが、ことあるごとに反目しあっていた。案の定、捜査開始直後から2人の間には一触即発の雰囲気が漂い始める。翌朝コールドウェルの家を訪ねたオースティンは、コールドウェルの娘ドナ(メグ・ライアン)と初めて顔を合わせ、たちまち激しい恋に陥るが、2人の愛は当然オースティンとコールドウェルの争いに拍車をかけた。だが事件の真相を追う2人は、少しずつ事実を解明していき、女性隊員を撃った銃は基地内のポール・ローレス中佐(ダナ・グラッドストーン)が所持していることが分かり、オースティンはチャイナタウンで彼を追いつめるが、すんでのところでローレンス中佐は黄色のトランザムで轢き殺されてしまう。やがて全ては財界の大物アーサー・ピール(マーク・ブラム)が絡んでいることが分かった。彼はローレンス中佐と組んで、フィリピンから大量の宝石を密輸していたのだ。さらに驚くべきことに、この密輸にはコールドウェルの古くからの戦友で親友でもあるロス・マクルア(ジャック・ウォーデン)も関わっていたのだ。だがマクルアは今は足を洗っており、ピールらの企みを何とかしてやめさせようと、単身彼らが取り引きしている現場であるブラック・マウンテン社の工場へ向かう。工場を見張っていたオースティンとコールドウェルがただならぬ気配を察知し現場へ突入すると、警報が轟き、激しい銃撃戦となった。遂にピールらは倒されるがマクルアもコールドウェルを助けるために撃たれてしまった。事件は解決し、マクルアは軍人基地に名誉の戦士として、コールドウェルの涙の弔辞に送られて安らかに眠った。今はオースティンもコールドウェルもお互いの立場を理解し合い、ドナと3人並んで軍人基地を静かに歩いていくのであった。

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